MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR05

Total Repeats: 1473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013748	GA	3	6	238	243	50 %	0 %	50 %	0 %	284176294
2	NC_013748	CGCCGA	2	12	449	460	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284176294
3	NC_013748	CAA	2	6	607	612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176295
4	NC_013748	CTT	2	6	625	630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176295
5	NC_013748	GTT	2	6	707	712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176295
6	NC_013748	TGA	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176295
7	NC_013748	GTG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176295
8	NC_013748	TCA	2	6	804	809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176295
9	NC_013748	ACTC	2	8	902	909	25 %	25 %	0 %	50 %	284176295
10	NC_013748	GC	3	6	1053	1058	0 %	0 %	50 %	50 %	284176295
11	NC_013748	TCT	2	6	1059	1064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176295
12	NC_013748	GCTT	2	8	1078	1085	0 %	50 %	25 %	25 %	284176295
13	NC_013748	CGC	2	6	1453	1458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176296
14	NC_013748	GC	3	6	1469	1474	0 %	0 %	50 %	50 %	284176296
15	NC_013748	CG	3	6	1478	1483	0 %	0 %	50 %	50 %	284176296
16	NC_013748	CGA	2	6	1526	1531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176296
17	NC_013748	CGC	2	6	1536	1541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176296
18	NC_013748	CGA	2	6	1634	1639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176296
19	NC_013748	TCG	2	6	1738	1743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176296
20	NC_013748	TCT	2	6	1750	1755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176296
21	NC_013748	TCGC	2	8	1764	1771	0 %	25 %	25 %	50 %	284176296
22	NC_013748	TAC	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176296
23	NC_013748	CGC	2	6	1806	1811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176296
24	NC_013748	CGA	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176296
25	NC_013748	GGCCG	2	10	1884	1893	0 %	0 %	60 %	40 %	284176296
26	NC_013748	CGC	2	6	1913	1918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176296
27	NC_013748	CGGT	2	8	1957	1964	0 %	25 %	50 %	25 %	284176296
28	NC_013748	CGA	2	6	2003	2008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176296
29	NC_013748	CGCCTA	2	12	2036	2047	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284176296
30	NC_013748	ACG	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176296
31	NC_013748	GAA	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176296
32	NC_013748	CGG	2	6	2654	2659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176297
33	NC_013748	GA	4	8	2673	2680	50 %	0 %	50 %	0 %	284176297
34	NC_013748	AT	3	6	2828	2833	50 %	50 %	0 %	0 %	284176297
35	NC_013748	CGT	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176297
36	NC_013748	TCAT	2	8	3004	3011	25 %	50 %	0 %	25 %	284176297
37	NC_013748	AGT	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176297
38	NC_013748	ATG	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176297
39	NC_013748	CAA	2	6	3352	3357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176297
40	NC_013748	TGA	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176297
41	NC_013748	GAA	2	6	3387	3392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176297
42	NC_013748	TGG	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176298
43	NC_013748	ACA	2	6	3498	3503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176298
44	NC_013748	TGA	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176298
45	NC_013748	CTAC	2	8	3635	3642	25 %	25 %	0 %	50 %	284176299
46	NC_013748	CGA	2	6	3656	3661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176299
47	NC_013748	GAC	3	9	3677	3685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176299
48	NC_013748	TGG	2	6	3724	3729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176299
49	NC_013748	TGC	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176299
50	NC_013748	TCC	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176299
51	NC_013748	CTGG	2	8	3814	3821	0 %	25 %	50 %	25 %	284176299
52	NC_013748	AGTA	2	8	4157	4164	50 %	25 %	25 %	0 %	284176299
53	NC_013748	TCG	2	6	4186	4191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176299
54	NC_013748	AC	3	6	4237	4242	50 %	0 %	0 %	50 %	284176299
55	NC_013748	T	6	6	4247	4252	0 %	100 %	0 %	0 %	284176299
56	NC_013748	AT	3	6	4258	4263	50 %	50 %	0 %	0 %	284176299
57	NC_013748	TCG	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176300
58	NC_013748	CAAC	2	8	4527	4534	50 %	0 %	0 %	50 %	284176300
59	NC_013748	TTC	2	6	4547	4552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176300
60	NC_013748	CGA	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176300
61	NC_013748	CAT	2	6	4596	4601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176300
62	NC_013748	AGCCAA	2	12	4944	4955	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284176301
63	NC_013748	TGG	2	6	5016	5021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176301
64	NC_013748	CCT	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176301
65	NC_013748	GAA	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176301
66	NC_013748	CCT	2	6	5375	5380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176301
67	NC_013748	CGA	2	6	5393	5398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176301
68	NC_013748	TC	3	6	5405	5410	0 %	50 %	0 %	50 %	284176301
69	NC_013748	ACG	2	6	5447	5452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176301
70	NC_013748	GAT	2	6	5466	5471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176301
71	NC_013748	CCG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176302
72	NC_013748	TCG	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
73	NC_013748	TCC	2	6	5641	5646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176302
74	NC_013748	CGTTCG	2	12	5668	5679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
75	NC_013748	CGGC	2	8	5680	5687	0 %	0 %	50 %	50 %	284176302
76	NC_013748	ACG	4	12	5724	5735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
77	NC_013748	CGACCA	2	12	5758	5769	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	284176302
78	NC_013748	TGA	2	6	5780	5785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176302
79	NC_013748	CTA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176302
80	NC_013748	AAT	2	6	5855	5860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284176302
81	NC_013748	CAG	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
82	NC_013748	GCG	2	6	6013	6018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
83	NC_013748	CGATT	2	10	6022	6031	20 %	40 %	20 %	20 %	284176302
84	NC_013748	GA	3	6	6040	6045	50 %	0 %	50 %	0 %	284176302
85	NC_013748	CCAAC	2	10	6092	6101	40 %	0 %	0 %	60 %	284176302
86	NC_013748	TCGAG	2	10	6118	6127	20 %	20 %	40 %	20 %	284176302
87	NC_013748	CGGAC	2	10	6128	6137	20 %	0 %	40 %	40 %	284176302
88	NC_013748	ACG	3	9	6138	6146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
89	NC_013748	ACTG	2	8	6267	6274	25 %	25 %	25 %	25 %	284176302
90	NC_013748	GAT	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176302
91	NC_013748	CA	3	6	6281	6286	50 %	0 %	0 %	50 %	284176302
92	NC_013748	GGA	2	6	6296	6301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176302
93	NC_013748	TTC	2	6	6315	6320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176302
94	NC_013748	GGC	2	6	6378	6383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
95	NC_013748	GAT	2	6	6498	6503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176302
96	NC_013748	AAC	2	6	6504	6509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176302
97	NC_013748	CCG	2	6	6514	6519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176302
98	NC_013748	GAA	2	6	6528	6533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176302
99	NC_013748	AG	3	6	6611	6616	50 %	0 %	50 %	0 %	284176302
100	NC_013748	GAG	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176302
101	NC_013748	ACG	2	6	6685	6690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
102	NC_013748	GAG	2	6	6723	6728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176302
103	NC_013748	CACAC	2	10	6739	6748	40 %	0 %	0 %	60 %	284176302
104	NC_013748	GAA	2	6	6795	6800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176302
105	NC_013748	TCC	2	6	6808	6813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176302
106	NC_013748	ACGG	2	8	6852	6859	25 %	0 %	50 %	25 %	284176302
107	NC_013748	GTC	2	6	6864	6869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
108	NC_013748	CGTT	2	8	6931	6938	0 %	50 %	25 %	25 %	284176302
109	NC_013748	CGTC	2	8	6945	6952	0 %	25 %	25 %	50 %	284176302
110	NC_013748	ACCT	2	8	6987	6994	25 %	25 %	0 %	50 %	284176302
111	NC_013748	GAA	2	6	7068	7073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176302
112	NC_013748	CGA	2	6	7112	7117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
113	NC_013748	CG	3	6	7149	7154	0 %	0 %	50 %	50 %	284176302
114	NC_013748	GAC	4	12	7199	7210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
115	NC_013748	CGA	2	6	7211	7216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
116	NC_013748	GCC	2	6	7260	7265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176302
117	NC_013748	CGT	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
118	NC_013748	CGA	2	6	7322	7327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
119	NC_013748	TGA	2	6	7334	7339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176302
120	NC_013748	GC	3	6	7375	7380	0 %	0 %	50 %	50 %	284176302
121	NC_013748	CTT	2	6	7472	7477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176302
122	NC_013748	GAA	2	6	7548	7553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176302
123	NC_013748	ACCG	2	8	7591	7598	25 %	0 %	25 %	50 %	284176302
124	NC_013748	TCCA	2	8	7656	7663	25 %	25 %	0 %	50 %	284176302
125	NC_013748	GAC	3	9	7683	7691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
126	NC_013748	GGTC	2	8	7703	7710	0 %	25 %	50 %	25 %	284176302
127	NC_013748	CCG	2	6	7749	7754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176302
128	NC_013748	GACTCG	2	12	7764	7775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284176302
129	NC_013748	AC	3	6	7843	7848	50 %	0 %	0 %	50 %	284176302
130	NC_013748	TCGA	2	8	7908	7915	25 %	25 %	25 %	25 %	284176302
131	NC_013748	CGGA	2	8	7931	7938	25 %	0 %	50 %	25 %	284176302
132	NC_013748	CGA	2	6	7970	7975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
133	NC_013748	CGG	2	6	7984	7989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
134	NC_013748	CGG	3	9	8009	8017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
135	NC_013748	GGC	2	6	8022	8027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
136	NC_013748	CGT	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
137	NC_013748	TGA	2	6	8156	8161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176302
138	NC_013748	CGG	2	6	8171	8176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
139	NC_013748	GTCG	2	8	8183	8190	0 %	25 %	50 %	25 %	284176302
140	NC_013748	CGAC	2	8	8221	8228	25 %	0 %	25 %	50 %	284176302
141	NC_013748	CGT	2	6	8245	8250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
142	NC_013748	TTCG	2	8	8277	8284	0 %	50 %	25 %	25 %	284176302
143	NC_013748	CG	3	6	8283	8288	0 %	0 %	50 %	50 %	284176302
144	NC_013748	CGG	2	6	8306	8311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
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148	NC_013748	TCG	2	6	8502	8507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
149	NC_013748	CGC	2	6	8525	8530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176302
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152	NC_013748	TGGCG	2	10	8652	8661	0 %	20 %	60 %	20 %	284176302
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154	NC_013748	GCCA	2	8	8677	8684	25 %	0 %	25 %	50 %	284176302
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158	NC_013748	GA	3	6	8976	8981	50 %	0 %	50 %	0 %	284176303
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161	NC_013748	TCG	2	6	9032	9037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176303
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169	NC_013748	ATG	2	6	9235	9240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176303
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247	NC_013748	ATTA	2	8	12972	12979	50 %	50 %	0 %	0 %	284176306
248	NC_013748	GAC	2	6	13050	13055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176306
249	NC_013748	CTT	2	6	13088	13093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176306
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251	NC_013748	GAT	2	6	13146	13151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176306
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253	NC_013748	GGC	2	6	13354	13359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176307
254	NC_013748	CGA	2	6	13365	13370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176307
255	NC_013748	TTC	2	6	13396	13401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176307
256	NC_013748	GAAA	2	8	13427	13434	75 %	0 %	25 %	0 %	284176307
257	NC_013748	TGG	3	9	13557	13565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176307
258	NC_013748	CGA	2	6	13602	13607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176307
259	NC_013748	GAC	2	6	13684	13689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176307
260	NC_013748	CAAC	2	8	13746	13753	50 %	0 %	0 %	50 %	284176307
261	NC_013748	ACG	3	9	13835	13843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176307
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382	NC_013748	CGA	2	6	19254	19259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176315
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386	NC_013748	CGG	3	9	19411	19419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176316
387	NC_013748	GGC	2	6	19449	19454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176316
388	NC_013748	TCG	2	6	19471	19476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176316
389	NC_013748	TCC	2	6	19480	19485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176316
390	NC_013748	TCC	2	6	19492	19497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176316
391	NC_013748	TGAC	2	8	19572	19579	25 %	25 %	25 %	25 %	284176316
392	NC_013748	CGG	2	6	19783	19788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176317
393	NC_013748	CGG	2	6	19799	19804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176317
394	NC_013748	GGCG	2	8	19836	19843	0 %	0 %	75 %	25 %	284176317
395	NC_013748	TCC	2	6	19853	19858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176317
396	NC_013748	CGC	2	6	19889	19894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176317
397	NC_013748	CGA	2	6	19932	19937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176317
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400	NC_013748	GCC	2	6	19981	19986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176318
401	NC_013748	TCA	2	6	20032	20037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176318
402	NC_013748	GACC	2	8	20042	20049	25 %	0 %	25 %	50 %	284176318
403	NC_013748	TGGA	2	8	20070	20077	25 %	25 %	50 %	0 %	284176318
404	NC_013748	CGA	2	6	20084	20089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176318
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406	NC_013748	ATCC	2	8	20102	20109	25 %	25 %	0 %	50 %	284176318
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409	NC_013748	CGAC	2	8	20282	20289	25 %	0 %	25 %	50 %	284176318
410	NC_013748	GCCG	2	8	20337	20344	0 %	0 %	50 %	50 %	284176318
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412	NC_013748	CGA	2	6	20366	20371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176318
413	NC_013748	CGA	2	6	20375	20380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176318
414	NC_013748	CCT	2	6	20402	20407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176318
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416	NC_013748	CCG	2	6	20455	20460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176318
417	NC_013748	AGTACG	2	12	20464	20475	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284176318
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420	NC_013748	TCC	2	6	20568	20573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176319
421	NC_013748	CGG	2	6	20805	20810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176319
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425	NC_013748	TCA	2	6	21009	21014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176319
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433	NC_013748	ACTC	2	8	21306	21313	25 %	25 %	0 %	50 %	284176319
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500	NC_013748	CGC	3	9	23775	23783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176321

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